環保團體地球公民基金會指出，台糖從2009年起擬釋出約777.5公頃土地，提供工業開發。其中高雄市路竹區新園農場已分割出租約60公頃給6家民營金屬與化學工廠；高雄市阿蓮區九鬮農場也將開發為150公頃的金屬扣件園區。
李根政表示，新園、九鬮農場內設有電鍍、酸洗工廠，嚴重威脅路竹、阿蓮、湖內優良農漁產業。新園農場「化整為零」的開發模式，規避環評、不設聯合管理中心，未來所有台糖地若全比照辦理，台灣的農業和糧食恐無未來。
高雄市茄萣舢筏協會前會長蘇水龍說，17年來經過民間努力，二仁溪從重度污染改善成中度污染。一旦新園農場開發下去，不僅17年整治二仁溪的成果將化為烏有，沒有統一管理中心的開發模式，日後恐更難監督查緝。
地球公民基金會呼籲，高雄市政府應停止台糖新園與九鬮農場的開發計畫，撤銷核可、拒絕新申請；發展路竹、阿蓮區優良農業及文化遊憩產業，拒絕工業污染入侵；內政部、經濟部和農委會應終止台糖土地不當釋出亂象；環保署應檢討環評機制漏洞。