環保局也強調，縣市合併之後，已依空氣污染防制法裁罰地勇公司高達15次，但其堆置情況依然沒有改善，此違規行為亦引起地檢署的重視，在2月23日地檢署環檢警的會議中，建請環保局積極管制。
環保局隨後於3月15日舉辦跨局處會勘，確認該公司堆置問題嚴重，為避免造成料堆持續擴大，日後產生更嚴重的污染及清理問題，故依據行政程序法第165條規定，以行政指導方式，通知上游廠商以源頭管制，相關決策過程，沒有受到任何外力影響。
至於6月初發文取消源頭管制的原因，環保局也說明，考量市府5月17日已邀集各相關局處，辦理地勇公司會勘，會中決議限期於6個月內完成全部農地移除，此獲地勇公司當場承諾（並於同年5月31日檢送清理期程計畫書），基於地勇公司有積極清理之誠意，並已回歸所屬相關主管法令，行政目的既已達成，無繼續行政指導之必要，才會發文取消源頭管制。
李穆生局長強調，加強對地勇公司的管制，是出自於勇於任事的積極作為，絕對可以坦然面對外界的檢視，但對於經濟部國營會專案小組，在未與環保局人員洽詢情況下，就逕行判定的作法，表示不解與遺憾。