漁業署指出，101年度休漁獎勵金自5月1日起開始申請，除專營娛樂漁業漁船及漁業權漁業配備的漁船外，凡領有特定漁業執照的漁船，自100年9月1日至101年8月31日止，累計出海作業90天及在港停航90天以上者，可於101年10月31日前，向當地區漁會或遠洋漁業公會提出申請。
署方補充，自願性休漁措施採漁船主自主性參與，凡漁船全年累積在港天數達90天，出海天數達90天，即可申請獎勵金，獎勵金額最低為舢舨每艘新台幣9600元，漁筏依其長度、漁船依其噸級分別核算，以總噸位1000噸級為例，約30萬8000元。
漁業署進一步表示，歷年持續辦理休漁獎勵，參加獎勵休漁船數自92年5620艘，逐年增加至100年9671艘；92至100年累計7萬1716艘次符合獎勵資格，共核發12億6145萬餘元。
休漁獎勵補助主要對象是近海及沿岸漁業，署方統計年產量在18萬到25萬公噸之間。