面對政黨高度競爭的環境，行政院秘書長的政治角色向來吃重；基層出身的陳士魁政治歷練不多，政治性格也不強，反倒是早年在台北市社會局、僑委會及後來在社會公益團體服務的經驗，讓他廣結善緣，能在現今政治意識掛帥的政壇擔任行政院秘書長，算是個異數。
陳士魁並非檯面上的「馬團隊」成員。他從行政院基層科員做起，在台北市政府服務期間，市長從楊金欉、許水德、吳伯雄至黃大洲；馬英九選上台北市長時，陳士魁早已到僑委會服務多年，並非其市政團隊成員；馬選上總統後，陳士魁曾任體委會副主委，協助處理跆拳道國手楊淑君被判失格案，深獲層峰賞識，讓馬一度想拉拔陳擔任國民黨台北市黨部主委。今年二月，陳士魁才成為陳內閣的副秘書長。
陳士魁與馬家的淵源，主要來自周美青。九十二年起，陳士魁出任馬所屬的敦安社會福利基金會執行長，在這裡與擔任該基金會董事的周美青共事多年。
後來，周美青在馬選上總統後，出任中華民國紅十字總會名譽會長，陳士魁又擔任紅十字總會秘書長，積極卻又圓融的處事風格，深受馬及周美青認同；但也因政治性格不強，始終扮演檯面下的技術幕僚角色。
如今，政治性格不強，意外成為朝野高調政治場域的生存利基；笑口常開的好脾氣，更是複雜政治環境與爭鬥氛圍下的王道。在林益世收賄弊案重創馬政府清廉形象之際，馬政府繞來繞去，沒有爭議的陳士魁就這樣異軍突起，悄悄在燈火闌珊處浮現。