媒體報導，中央研究院院士林毓生認為大學評鑑制度不當，嚴重干擾學術自由空間，決定在院士會議連署提案。
中研院院士林毓生返國參加院士會議期間，走訪各大專院校，發現許多教授苦於應付評鑑，有些學校動支上萬元經費，召開100多場準備會議，印製的文件堆積如山。他認為評鑑不該做得太頻繁，也不該成為淘汰辦學不佳大學系所的工具。
林毓生接受「中國時報」訪問時表示，將在今天下午的院士會議中，提出連署提案，請總統馬英九正視大學評鑑制度亂象。
教育部長蔣偉寧今天上午出席院士會議，會間受訪表示，教育單位願意傾聽各方意見，他基本上認為，評鑑還是要好好的做，因為「評鑑對學校發展是很關鍵的。」
蔣偉寧表示，教育部正著手改善評鑑制度，過去較重視「指標」的方式，會有所調整，未來朝向由各校建構良好的「自評」機制，不再由評鑑中心派一群人去打分數。研究型、教學型、科技大學等不同類型的學校，也可依各自的發展特色，在教育部規範的「大項」下自我評鑑。
蔣偉寧表示，大學自評的相關辦法，教育部已在緊鑼密鼓地研擬中，希望能在7月底公布，最快明年就可實施。前幾年由頂尖大學、教學卓越計畫的學校開始，再逐步推展至各大專院校。
另外，林毓生建議大學評鑑由現行5年1次改成10年1次，減輕學校的負擔。蔣偉寧表示，相關制度都可討論，教育部目前傾向先合併各大小評鑑，原則上還是5年1次，因為目前大學校長的任期大都是4到8年，若10年才做1次，可能有些校長任內都沒有經歷一次完整的評鑑，不太合適。