新華社報導，與神舟八號任務不同，這次組合體轉為倒飛，是為了滿足太空人在太陽光照區進行手控撤離需要。
北京通信與跟蹤技術研究所高級工程師、神九任務主著陸場主任設計師呂明濤指出，神舟九號返回地面要經過4個階段。
第1個階段是制動飛行階段。太空船在太空中飛行最後一圈時，地面測控部門向太空船發出返回指令，太空船隨即調整姿態，發動機點火，進入返回軌道。
第2個階段是自由滑行階段。太空船以無動力飛行狀態自由下降。高度降至距地面140公里時，推進艙和返回艙分離，推進艙在穿越大氣層時燒燬，返回艙繼續下降。
第3個階段是重返大氣層階段。太空船進入大氣層時，太空船表面和大氣層摩擦產生高熱，在太空船表面形成高溫等離子氣體層，並使太空船在240秒內與地面失去聯繫。直到距離地球約40公里處，地面測控部門重新捕獲太空船。
第4個階段是著陸階段。返回艙距地球約10公里時傘艙蓋打開，拉開引導傘、減速傘、主傘等。在距離地面1.2公尺時，4台反推發動機點火，太空船以每秒1至2公尺速度著陸。
神舟九號主著陸場副指揮長崔小軍表示，陸航部隊已完成回收太空船之前的準備工作，將有7架直升機參加任務。
這7架直升機分別是1架指揮機、1架通信機、1架搜救機、1架醫監醫保機、3架醫療救護機。7架直升機都安裝了大陸自行研發的北斗導航定位系統。
其中醫監醫保機設置3把躺椅，供太空人換下太空服、體檢、休息。考慮到女太空人的私密性，機艙後部專門隔了一個艙室，由2名女醫生幫助劉洋體檢。
崔小軍透露，與神舟七號相比，神舟九號的回收增加了1架通信直升機，加裝了機載光學吊艙、機載測向定位系統、超短波寬頻通信系統和機載中繼衛星通信系統等設備，空中搜救分隊可接收太空船在返回階段發回的信號，並即時傳輸穩定、高清圖像。
神舟九號著陸場位於內蒙古四王子旗，預定29日返回地球。