八十四歲的穆巴拉克十九日被直升機從監獄醫院載往開羅的馬赫迪軍醫院，住進加護病房。有關他的病情冒出各種講法。埃及國營媒體一度引述其醫生的話說他已「臨床死亡」（即心、肺、腦皆停止運作）。
軍方廿日上午承認穆巴拉克中風陷入昏迷，必須靠人工呼吸器維持生命，唯距離臨床死亡尚遠。安全官員後來聲稱他雖然昏迷，但已不需仰賴維生系統，他的心臟和其它重要器官都能運作。
埃及本月十六、十七日舉行總統選舉第二輪投票，穆巴拉克過去極力打壓的「穆斯林兄弟會」宣稱，他們支持的「自由與正義黨」主席穆爾西贏得勝利。但穆巴拉克下台前的末代總理沙菲克也宣稱勝選。
埃及選委會要到廿一日才公布選舉結果，但兩個陣營已劍拔弩張。另外，目前掌權的武裝部隊最高委員會，最近做出一系列擴大權力的措施，包括解散國會，將立法權收歸己有等，令穆斯林兄弟會非常不滿。
數萬名群眾廿日響應穆斯林兄弟會號召，在開羅解放廣場聚集，抗議軍方攬權干政。一些活躍人士更批評軍方解散國會的作法形同「軍事政變」。
穆斯林兄弟會曾揚言一旦掌權，將重審穆巴拉克，將他處以死刑。穆巴拉克若在此時死亡，勢必使埃及出現更尖銳的對立。
穆巴拉克就醫的醫院外，支持和反對他的群眾徹夜守候。一名支持他的婦女激動地說：「我愛他。」另一名支持者舉著他的肖像海報說：「我愛他更甚於我父親。穆斯林兄弟會盡是些罪犯。他們毀了這個國家。穆巴拉克帶給我們卅年和平。」
一群反穆巴拉克的年輕人則喊道：「我們一窮二白，他卻袖手旁觀。他的家人吃肉，我們挨餓！」一名抗議者說：「我準備用我的鞋子去敲打他的墳墓。」