總統馬英九日前宣示，為了台灣的未來，美牛案一定要過關。經濟部長施顏祥表示，只要美牛案解決，就可在年底前重啟台美貿易暨投資架構協定（TIFA），進一步洽談台灣重視的經貿議題，以堆積木方式朝台美自由貿易協定（FTA）方向邁進。
經濟部指出，由於台灣目前輸美大宗產品以電子與機械為主，未來TIFA優先洽談的議題，包含技術性貿易障礙、電子商務合作等，因此將優先洽簽商品檢驗相互承認協定，並在網路交易便利性以及法規透明化方面與美方交換意見。
另外，除了積極洽簽台美FTA外，雙邊投資協定是FTA內容重要一環，加上政府希望藉此促進台美雙邊投資，因此納入TIFA復談後的重要議題。
農業方面，台灣也將要求美方開放台灣帶介質的文心蘭銷美。行政院農委會主委陳保基強調，蘭花是台灣農產品對外競爭強項，目前文心蘭雖可銷往美國，但不得帶介質，以致長途運輸過程存活率很低，一旦開放帶介質銷美，將可為花農開啟龐大的商機。
至於美國在意的部分，則包括智財權保護，如對營業秘密侵害，採取更嚴格法律保護，及健保藥價訂價機制與有線電視市場進入限制等。