財政部說明，稅籍清查是財政部各地區國稅局年度例行作業，目的在確定營業人稅籍登記資料的正確性。台北市國稅局稅籍清查從4月1日開始進行，曾在3月20日發布新聞稿預告。
財政部表示，台北市國稅局大安分局於6月6日下午派員到忠孝東路四段，共訪查65家公司。柯一正的藍月電影公司所在大樓相同地址登記有 4家公司，國稅局人員核對稅籍資料後即離去，沒有針對性，也沒有後續查稅。
自由時報報導，柯一正與作家駱以軍等藝文界人士日前化身快閃族，於總統府前凱達格蘭大道躺成人字型，同時舉手高喊「我是人，我反核！」事後國稅局突然到公司查帳。