適才適性、均衡發展
校長薛錦彰表示，該校地處偏鄉，家長經濟弱勢與隔代教養比率偏高，但每個學生都是一塊塊的璞玉、千里馬，只要慧眼、有伯樂，就能讓學生們獲得發展，校方把學生生涯發展教育適性輔導機制列為重點，開發每位學生性向與興趣潛能，成就自信心與學習力。
薛錦彰說，因為適性教育所以學校培育出目前是職棒桃猿隊隊員的林家瑋、去年學測滿級分的郭芳慈、獲得全國技藝競賽生物產業機械科金手獎的許昭煌等…，成為台灣之光、雲林之光。
「二○一二優質國中一百選」由親子天下與教育部合辦，主要在於評選培養健康、快樂、學習扎實、五育均衡學生的學校，馬光國中入選生涯發展優質學校，也是雲林縣唯一一所入選的國中。