對於國台辦的回應，陸委會昨表示，中華民國是主權獨立的國家，總統所言均依中華民國憲法，「互不承認主權、互不否認治權」是對兩岸現狀最好的解釋，也是雙方正視現實、擱置爭議的最好方法。
經過十天評估，國台辦的回應基調都是依「胡六點」所闡述，並未實質評論馬的論述。至於馬總統強調德國統一模式或可作為兩岸發展借鑒，楊毅說，兩德情況和兩岸不同。「兩岸應繼續共同努力，走出一條適合兩岸情況、符合中華民族整體利益的兩岸和平發展、和平統一之路。」
馬總統五二○就職演說後，大陸隔十天才回應，與四年前馬總統當選首任，當時國台辦主任陳雲林隔二日即回應不可同日而語。
針對馬總統的新論述，楊毅說，大陸和台灣儘管尚未統一，但中國主權和領土完整沒有分裂，兩岸同屬一個中國的事實沒改變，兩岸不是「兩個中國」，兩岸關係不是國與國關係。這是客觀事實。
他說，對於符合這一客觀事實的言論、主張、政策，都是有積極意義的。至於兩岸長期存在的政治分歧，這是眾所周知的，所以大陸一貫主張擱置爭議、求同存異。
對民進黨主席蘇貞昌表明在不預設前提下，願以適當身分訪大陸，楊毅說，「民進黨堅持『一邊一國』的台獨主張，這是我們與他們交往的最大障礙。大門始終是敞開的，關鍵是看民進黨什麼時候拆除自己設置的障礙。」
對稍早引起話題的國台辦兩位副主任鄭立中及葉克冬來台「全省走透透」，楊毅說，大陸人士赴台交流訪問「都應深入民間」，這是大陸一貫的理念和做法。