羊痘病毒是羊隻集體感染致死的隱形殺手，為防範疫情擴大，以往政府都都需花費龐大預算，靠進口羊痘疫苗來防治；目前國內已經研發成功「羊痘活毒疫苗」，獲農委會防檢局核准使用，由於疫苗品質安全穩定，保證有效期10個月，現已獲准延展為15個月，對羊隻畜產業者助益不少。
畜產羊隻帶動觀光產業，但是羊痘疫情會讓業者損失慘重。（圖片／取自農委會網站）
6年前桃園縣爆發台灣有史以來，第一樁畜產羊隻集體感染羊痘事件，造成羊隻遭到大量撲殺掩埋，業者損失上億元。詎料，2年前雲林縣又出現慘重疫情。由於目前對於羊痘病毒感染，無有效治療方法，唯有全面注射「羊痘活毒減毒疫苗」，降低發生機率。因此，農委會呼籲全國養羊農友，應依規定配合為羊隻定期施打，或補強注射疫苗，並做好自家生物安全防衛措施，杜絕疫情出現。
農委會家畜衛生試驗所製劑研究組黃天祥組長指出，台灣99年4月羊痘疫情造成損失包括撲殺補償費用、疫苗、實驗研究、縣市防疫所及注射人力費，最少3億元以上，不過，幸於該年6月25日起全面施打疫苗後即時發揮效果，羊痘疫情獲得控制，顯示羊痘活毒減毒疫苗免疫效果良好。
為杜絕羊痘疫情再度上演，家畜所於100年5月11日製造小量包裝之羊痘活毒減毒疫苗，每瓶20劑量，共計34萬劑量，並於當年8月通過國家檢定，取得羊痘活毒疫苗製造許可證，隨即委託經甄選合格之經銷商，經農企業有限公司銷售供防疫使用。
黃天祥強調，羊痘係羊隻的高度接觸性傳染性病毒性疾病，以皮膚發紅疹為主要特徵。病程初期，病變呈現丘疹，隨後轉為膿疱疹，至全身性病變時，可能會有呼吸道，和胃腸道黏膜出血性炎症反應發生，並造成死亡。在自然情況下，綿羊痘和山羊痘具有宿主特異性，彼此間具有免疫抗原相關性，有些病毒株則會同時感染綿羊和山羊兩種動物，而人類則不具感受性。
羊痘目前無有效治療方法，疫區羊隻施打羊痘減毒活毒疫苗，是預防羊痘首要步驟，養羊場平時應做好自家生物安全防衛措施，引進羊隻前需予隔離檢疫。現場如發現，疑似羊痘感染羊隻，應儘速通知當地縣市家畜疾病防治所，經確診為羊痘感染時，罹患羊隻應儘速撲殺，並妥善處理羊隻屍體和產物。感染區動物和車輛進行移動管制及嚴格執行消毒。