報導指稱吳敦義選後勤走基層是「接收馬英九選戰資源」，並透過國民黨秘書長林中森負責操盤。但吳敦義表示，當初馬英九決定找林中森接任國民黨秘書長，隨後才告知他此一訊息。
吳敦義表示，當馬英九提及要找林中森接任國民黨秘書長，他當場反問，「林中森過去不熟黨務，到底行不行？」最後馬仍決定讓林接掌黨務系統。
吳敦義也解釋，他選後一連串謝票行程，並不是接收選舉資源，這些輔選團隊成員都是舊識，沒有接收不接收的問題。
至於副總統夫人蔡令怡隨扈雷惠雅與總統馬英九座車司機葉俊毅竟是夫妻關係，據轉述，在吳敦義要求下，國安局已將雷惠雅調回原單位，重新配屬另一名隨扈。國安局也說，雷惠雅與葉俊毅雖是夫妻，但都經過安全考核，兩人分別負責正、副總統及其家人的警衛工作，並沒有違反相關規定。
幕僚表示，當初隨扈由國安局指派，吳敦義夫婦根本不了解隨扈背景婚姻狀況，壹週刊大作文章，有失公道。
此外，相關報導指高層一度規劃讓行政院副院長江宜樺接掌國民黨秘書長，江宜樺昨天也反駁這是政壇謠言，都是空穴來風。
他說，總統在農曆年確曾約見談組閣，當時第一夫人周美青根本不在場，週刊報導「比較是寫小說，毫無根據」。
江宜樺表示，除在公開場合與周美青同台外，從未在官邸與周美青碰過面。
對於壹週刊報導周美青提及自己輔選時「我唱唱跳跳也是為國民黨打拚」，與周熟識的政院副秘書長陳士魁更說，「這哪是夫人的用字遣詞，根本是亂掰的」。