新台灣國策智庫昨舉辦「解析馬英九就職演說與中外記者會」座談會。吳榮義表示，馬英九將有爭議的「一國兩區」放進就職演說，沒有為錯誤決策向人民道歉，根本是沒有新意、沒有道歉、沒有反省、沒有堅持，國際社會認定的「一中」根本就是中華人民共和國，不是中華民國，「一國兩區」只會讓台灣更陷入「一個中國」的框架。
劉文雄指出，馬強調「一個中華民國、兩個地區」，就是覺得自己不是中華民國，才會強調中華民國，馬是童話故事「魔鏡」自認美麗卻醜陋的皇后，自我感覺良好，卻聽不進人民的聲音，馬主張互不承認主權、互不否認治權，更是非常愚蠢，中國會接受嗎？在馬演說後，中國的智庫學者紛紛對此強烈批判，就已經呈現中國的態度。
張炎憲也說，中華民國只能代表台灣，不能代表中國，否則民代應由台灣、中國人民共同選出，馬的演說都是官樣文章，講得冠冕堂皇，但每樣事情都矛盾，司法公平、經濟結構、產業發展、南海問題等重要議題都不談，只談與中國關係，也不談全球化問題，只想混過去就算了。
中研院歐美研究所副研究員黃偉峰指出，馬在就職演說大談「一個中華民國、兩個地區」，這與美國的「一中政策」有點出入，因為美國認為，台灣的國際地位是沒有解決的，若台灣自認與中國是同屬一個國家，美國將陷入銷售武器給其他國家製造內戰的問題中，讓美國對台軍售產生困難。