台南市20日部分區域因12小時累積雨量飆破200毫米，永康區、歸仁區、仁德區等處淹水，仁德工業區及開發工業區水深逾40公分，多戶人家及工廠員工緊急撤離。
部分市議員質疑賴清德治水不力。賴清德說，這次水災肇因於三爺宮溪流域水位暴漲，三爺宮溪屬中央管轄，許多防汛工程正施工中，尚未完成，但治水議題不應政治化，不該淪為口水戰，只有中央和地方合作，才能有效防治水患。
市府表示，全台易淹水地區，台南市佔1/3，治水是重大市政項目，但很多項目需要中央預算支持，二仁溪等多條河川也屬於中央管轄，台南市有龐大的治水預算缺口，治水成了沉重的財政負擔，有待中央和台南市共同解決。