愛滋媽媽生的小孩常被稱為「疑似愛滋寶寶」，但是不一定會遭到媽媽體內的病毒感染，他們必須經過18個月的照護與檢驗後，才能確定有沒有感染愛滋病毒。臺北市立聯合醫院昆明院區自民國97年1月1日起，依疑似愛滋寶寶醫療照護規範作業，至今已追蹤管理「疑似愛滋寶寶」累計達49名，只有1名因未能配合政府的預防措施而成為「愛滋寶寶」，其餘39名皆為已排除感染的健康寶寶，9名仍持續在照護管理中。
預防寶寶受到愛滋病毒感染，可讓新生兒在出生之後持續4-6週的預防性投藥。
臺北市立聯合醫院昆明院區性病及愛滋病防治組護理長謝英慧指出，愛滋病毒陽性的產婦，如果在生產過程當中沒有做任何防護措施，生下來的寶寶大約有25-40%會被愛滋病毒感染，但若愛滋媽媽接受適當的預防措施，寶寶遭愛滋病毒感染的機會可以降到小於2%。
臺北市唯一的1名愛滋寶寶，是因出生後並未配合完整的服藥。只要配合預防措施，感染者即使懷孕也有很大的機會生下健康寶寶。
謝英慧強調，預防寶寶受到愛滋病毒感染的措施，首先是降低母體愛滋病毒量，臨床研究證明母親從第二孕期便開始使用抗愛滋病毒藥物，可降低母體的愛滋病毒量。其次是選擇剖腹產的生產方式，在產痛與破水之前即進行剖腹產，可以降低至少50%的垂直感染率。再來是避免餵母乳，長期哺餵母乳會使傳染率增加兩倍，應避免哺餵母乳而採取替代餵食方案。
最後是藥物預防與全程配合都治計畫進行，讓新生兒在出生之後持續4-6週的預防性投藥，可以大幅降低傳染率。目前許多醫院所採取的預防藥物為ZDV（2 mg/公斤口服，一天4次），出生後8-12小時之內（越早越好，只要新生兒可以進食便可以給予）開始使用持續六個星期，將可進一步降低垂直傳染率。