台南市政府教育局表示，2012年總統教育獎初審，經初審委員書面初評和實地至校複評，國中組及國小組各選出特優學生4位，代表台南市參與全國複審。
教育局表示，推薦參與全國複審的學生，如榮獲總統教育獎，將由總統頒給獎狀、獎助學金及獎座等，而其他入選為總統教育獎初審的學生，由市長賴清德於總統教育獎初審頒獎典禮中，頒發圖書禮券及獎狀乙紙獎勵。
代表台南市參與總統教育獎複審的學生名單為國中組─中山國中蕭如邑、玉井國中陳凱盛、東山國中張仕泓、崇明國中莊謹聲。國小組─永福國小吳怡慧、南大附聰林毓翔、海東國小林芷伊、樹人國小陳莊媚。
獲得台南市總統教育獎優等，將由市長賴清德頒獎表揚名單為國中組：金城國中蔡宜錚、安平國中鄭宛秦、民德國中方友廷、忠孝國中陳梓盈、東原國中蔡東欣、官田國中賴佳琳、安定國中謝佩汝、仁德國中劉怡婷等8人。國小組：文昌國小廖敏秀、新民國小古德曼安雅、關廟國小黃禹慈、成功國小林睿萱等4人。