最高法院在今年初做出決議，未來法官原則上只主動調查對被告有利的事項，檢察官須負起百分之百舉證責任，若舉證不足，被告可能獲判無罪；日前最高法院又撤銷柯居財偽證案的有罪判決，發回重審，理由是檢察官在被告到庭後延遲約1個半小時才訊問，恐構成不當取供。
最大的基層檢察官組織「中華民國檢察官協會」今天聲援吳巡龍等人。檢協會理事長施慶堂說，確有不少檢察官對最高法院見解不以為然，法官若只主動調查對被告有利事項，恐違反中立原則；若延遲訊問會構成不當取供，將壓縮檢察官辦案空間。檢協會近期要開會，討論以何種方式聲援。
對於基層檢方的質疑，最高法院表示，年初的決議是為符合聯合國兩人權公約，也未違刑事訴訟法，而偽證案的見解，案件尚未定讞。最高法院認為，檢察官動輒以民粹方式表達法律不同見解，無助維護整體法律秩序。
新竹地檢署檢察官陳瑞仁表示，外界可能誤會檢察官六四運動，是不想負舉證責任。但檢察官所抗議者，是最高法院不但禁止法官做積極調查，也禁止檢察官做積極調查。基層檢察官希望最高法院檢討並修正爭議判決與決議，如果訴求未獲回應，六四陳情後會「擴大戰線」。
陳瑞仁舉例，檢察官偵辦時從手槍本身驗不出被告指紋，審判時法官發現手槍其實另有包裝紙，主動依職權將包裝紙送驗，結果驗出被告指紋而判被告有罪，若照最高法院的邏輯，被告上訴一定成功，因為法官違反「只能主動調查被告有利的證據」，但這是人民要的公平正義嗎？1010509