毛治國說，未來國道計程收費有兩個前提，以民國100年為基期，全年國道通行費收入不超過新台幣220億元，從基隆到高雄的通行費不能高於現在的計次收費。
國道計程收費的費率仍在研議中，毛治國說，討論階段時，所有學者都反對有免費里程，認為違反「使用者付費」公平原則；但交通部的立場是，現在部分國道短途不收費，用路人的使用習慣一定要考慮，計程收費後會提供每位用路人每天都有固定的免費里程。
至於免費里程的長度，毛治國說，仍在試算中；不過，他也表示，免費里程不能太多，否則會增加國道長途用路人的負擔。
民進黨立委李昆澤、國民黨立委林明溱建議，國道計程收費後，免費里程應有30公里，民進黨立委管碧玲則提50公里。
李昆澤說，現在國道1號汐止到圓山13公里不用收費，計程收費後，天天行駛相同路段的用路人，1個月將多增加新台幣506元支出；國道10號左營到旗山30公里，現在是不用收費，進入計程後，天天行駛同樣路段的用路人，增加1000多元通行費。
毛治國回應，免費里程太長會有翹翹板作用，當免費里程愈長，計程收費的費率就會愈高，尤其對長途用路人更不公平，通行費可能是計次收費的好幾倍。
國道電子收費ETC上路6年，根據高速公路局與營運ETC的遠通電收的合約，今年底前完成國道計程收費建置，高公局預計明年初進入計程收費。