金牌失竊案經媒體報導，部分電視名嘴對案情大吹大擂，如同親眼目睹般，林玉山昨召開記者會加以駁斥。他強調，金牌是放在行政辦公室保險櫃而非軍械室，島上也不是只有海巡官兵，還有國家公園管理處人員、空軍、學術研究人員，而且指揮部四周未建圍牆，非僅海巡官兵能出入。
這件外島離奇竊盜案件，疑發生於三月一日之前，但一直到四月十二日，東沙指揮部才向高雄市警局鼓山分局報案，由高雄地檢署檢察官李廷輝率鼓山分局偵查隊，於十八、十九日登島偵查，採集可疑跡證。
他說，保管人會例行性清點金牌，此次保管人為曾姓上士，他三月一日收假返島，要清點金牌時，即發現保險櫃無法正常開啟，而外觀也沒有異狀，因島上沒有專業鎖匠，一直到四月十日，才找到鎖匠搭乘飛機登島開鎖，打開赫然發現裡面總重約一○五九公克的二六九面金牌，全部不翼而飛，十二日向警方報案。
他強調，海巡署南巡局督察室正配合檢警調查此竊案，等偵查有了結果，海巡署將會秉持毋枉毋縱原則依法處理。