段宜康舉行記者會表示，接獲民眾檢舉，衛生署沒符合「替代役實施條例」相關規定，讓替代役男以自己的名義對外發文，行使公權力，包括可執行採購、發文給總統府，他質疑政府部門涉嫌違法。
他說，現行法律規定，替代役男違抗監督長官的勤務命令者，處1年以下有期徒刑、拘役或科或併科新台幣10萬元以下罰金，這些役男是奉命行事。
衛生署官員在記者會中表示，以替代役男名義發文，確實不符規定，衛生署政風單位已完成調查，並將懲處違失的相關承辦人員等。
內政部役政署管理組長卓煥新說，役男執行勤務須在管理單位指揮調度下，但目前法規對需用機關沒處分規定，若需用機關運用役男有不合規定的情況，役政署會要求改善或調降員額，若不改善就取消役男員額。
段宜康要求行政院檢討，並要求役政署全面清查全國有多少機關違法使用替代役男？卓煥新表示，1個月內全面清查全國需用機關運用役男狀況，也會對這件衛生署個案提出報告。