國安官員透露，不管表面如何，台日官方在檯面下均有默契視保釣活動像「每隔一段時間出疹子，不會危害健康」，雙方各表立場但關係不受影響，未如外界想像緊張。
國安官員指出，釣魚台主權，台日雙方都不可能讓步，只能擱置爭議來化解紛爭。國安官員舉例，除了釣魚台主權爭議，包括像是之前日方片面實施重劃台日間的防空識別區（ＡＤＩＺ），表面上台灣聲明，未來台日雙方防空識別區範圍將在與那國島上空產生部分重疊的現象，台灣政府將堅持在該空域現行的相關作業方式，確保航管及飛航安全，並再次重申不接受日方該一決定的一貫立場，但事實上，檯面下兩國已有溝通，有默契的「各表立場」，台日各自表述國家立場之後，擱置爭議。