施顏祥說，澎湖發電的成本每度是八元、金門十元、馬祖十四元，但因全國國民一視同仁，「離島建設條例」規定由政府補貼台電離島電價與成本間的價差，過去是因為台電有盈餘，因此行政院要台電吸收，因為盈餘繳庫會再拿出來，「都是同一個口袋」。台電董事長陳貴明則說，因為台灣與澎湖間正在興建電纜，未來可從台灣本島輸低成本的電至澎湖，有機會降低澎湖的發電成本。
國民黨立委廖國棟對此不滿表示，經濟部的欠款導致離島承擔汙衊，被外界誤會是造成台電虧損的原因。對此，施顏祥則強調，這次電價調整時僅考量燃料因素，並不是要彌補積欠台電的離島電價部分，這部分並無實質影響。
國民黨立委楊瓊瓔則認為，「一條歸一條」，行政院要負責這筆積欠台電的費用，五三三億元應要還給台電。李桐豪也主張，這筆費用應由離島建設基金直接撥款，而不是由經濟部承擔，應向行政院提出要求。
施回應，會向政院反映。台電則指出，二○○○至二○一一年間，離島供電虧損四八三億元，行政院原則將採先行記帳方式處理，等台電未來有盈餘時則盈餘免予繳庫，予以扣抵離島供電虧損，可避免虛增總預算。