外界解讀陳菊團隊此舉是邀學者專家來背書，對南部獨派團體、基本教義派等釋出風向球，意喻她的大陸政策將採開放歡迎的態度，以挹注日漸衰退的城市競爭力。
會議由陳菊親自主持，她強調，面對中國大陸的強大崛起，世界各國皆無法置身事外，兩岸關係快速轉變，市府主張以平等、互惠、對等、尊嚴，並在符合法律規範之下，與中國在互動中瞭解、交流中認識，增進兩岸之間產業效益，帶動經濟成長。
陳菊說，ＥＣＦＡ屆滿一周年，研考會今年三月委託中華徵信所，針對五三六家高雄在地製造業者及兩千多名民眾進行感受度調查，檢視ＥＣＦＡ對台灣產業、民生影響及是否達到預期效益。根據各項數據顯示，南部企業對於ＥＣＦＡ的實際效益，感受度明顯不足。
陳菊建議，中央應提出具體配套措施，積極輔導、協助研發升級受衝擊產業，協助受益產業開拓外銷市場，並針對受影響勞工提供支援措施，以達到「企業根留台灣」、「創造在地就業」。
她說，目前ＥＣＦＡ僅是協議架構，未來有可能簽訂貿易協定，她也期盼政府在簽訂過程應公開透明，讓人民充分了解內容及影響，落實照顧本土企業。
高市府兩岸工作小組年度第一次委員會議，邀請林德昌、陳明通、童振源等全台兩岸專家學者共同參與、提供建言，並就現階段兩岸情勢整體分析，同時藉由小組成員的意見交流，讓市府各局處妥善因應、處理兩岸交流事務，增進彼此的認識與瞭解。
而面對高市府成立兩岸工作小組對大陸推動觀光行銷，台南市府卻沒有類似的計畫；市府新聞及國際關係處長陳宗彥指出，台南市將透過民間力量，一併對大陸、日、韓等國進行醫療觀光行銷，目前並未考慮單獨對大陸的行銷工作成立任何新組織。