台灣智庫執行長郭建中表示，智庫認為稅改方案應該要符合兩個原則：落實社會公平正義、合理增加國家稅收，但是目前的方案還不符合這些原則。智庫並批評財政部目前提出的證所稅方案是「下策」，立委曾巨威所提出的方案也只算是「中策」；智庫主張只有將證所稅的課徵回歸到所得稅法，並修正規定，允許投資人在3年內盈虧互抵，並對持有時間在一年以上即減半課徵，才是真正的「上策」。
台灣智庫今(16)日在台大校友會館召開記者會，對於剛出爐的財政部所方案提出檢討。
也是「財政健全小組」委員之一的台大經濟系教授林向愷表示，開會時委員對於「量能課稅」有共識，但從未對於「抓大放小」有共識，他不知道這個原則從何而來？開會期間的共識最終卻和決議不同，表現出缺乏程序正義。此外，他也批評財政部沒有做好功課，對於目前的方案可以課到多少稅都沒有提出計算，他擔心未來可能出現只存在稅目，卻無稅收的假改革。
台北大學財政系教授蘇建榮則表示，稅改的目的是為了符合租稅正義，但財政部版的方案採取訂定高門檻，又分離課稅，這已經偏離了原本稅改的目標了。而目前不論是財政部版或是曾巨威版，都可能造成投資人為了不超過免稅門檻，而設立人頭帳戶的問題，如此一來，對財政部和投資人都造成更高的成本。
民進黨立委林佳龍則質疑，政府這次的稅改究竟是真的改革？還是假改革之名行反改革之實？林佳龍表示，劉憶如之前提到，財政部方案要到9月立法院審議後才會有結果，在此之前其他方案的都不可以提出，而這次證所稅的改革幅度小，不確定性又高，能增加多少公益也不確定，其他包括中央地方財政收入支出劃分等真正需要討論的賦稅問題，卻可能因此被排除討論。他因此懷疑證所稅議題是政治性，而非財政性的，目的只是為了掩蓋其他民生問題。
林向愷認為，財政部掌握的資訊較完整，呼籲財政部應該設算各個方案的利弊得失，並公布給大眾。