海洋局指出，鑑於海域幅員廣大且一般交通工具不易到達，於是配合環保署與空勤隊訂定支援執行環境污染調查勤務協議，例行稽查由空勤總隊於訓練、例行飛航勤務時兼施，倘若發現高雄市沿近海域發現海洋汙染情事，則由飛行員利用航空器通訊系統通知地面值班台執勤人員，再以電話及傳真轉通報環保署及高市海洋局前往稽查，
海洋局除配置稽查車、艇待命外，並設置0800-265000免付費專線及專人接聽通報；如遇緊急海洋汙染事件，海洋局也可直接電請環保署向空勤總隊申請緊急派遣稽查飛行任務。
海洋局說，從空中監控高雄市沿近海域是否有船舶違規排放廢油或廢水，成效不錯，99年1月，近萬噸級貨輪「艾斯號」艙內裝載290噸燃油擱淺於高雄外海，海洋局當時即由空勤總隊協助，凌空督促船東布設防範油汙溢漏設施，最終得以零汙染收場。
海洋局另籲請海上作業船隻備妥基本緊急救護器材，並妥善完成出海前相關檢查與準備工作，確保海上航行安全。