比較特別的是，金門人在金門使用金門卡完全免費，一旦在台灣使用智慧卡，要記得先儲值。
「金門交通卡」電子票證於一九九九年建置，在當時為全國首創，拜金門好福利所賜，設籍金門在金門搭乘公車、大小金門交通船全部免費。
金門公共車船管理處有鑑於金門卡使用十三年來，擴充性不足，提出「票證系統整合計畫」，獲離島基金補助八百二十一萬元，縣府自籌五百二十五萬元，辦理汰換舊票證系統及換發金門卡，新系統的金門卡由台灣智慧卡公司建置。
車船處表示，新系統票證設備除可刷台灣智慧卡外，也可感測悠遊卡，對於持有悠遊卡背包客是一項便利措施。
新發行的金門交通卡為台灣智慧卡，在台灣本島可使用範圍包括北北基十六家客運業者、桃竹苗六家客運業者、中彰投雲嘉南十八家客運業者、花東地區家客運業者及台鐵部份路段使用等。
車船處指出，新卡即日起受理換發，舊卡至五月底停用，籲請鄉親注意。