立法委員輪番質疑，將上路的二代健保欠缺公平性及可行性，希望衛生署謹慎考量後，再次重提回到家戶總所得制，衛生署長邱文達回應，二代健保是經立法院修法通過，行政部門須執行，然而二代健保較一代健保公平，從實務面論，二代健保社會公平性高、可行性也高。
財稅學者、曾任健保局總經理朱澤民應邀赴立法院出席衛環委員會時表示，當初的家戶總所得制被推翻的原因是，有委員誤認須待財政部2年後的資料出爐後才能結算徵收，事實上這都是就源扣繳，家戶總所得也是。因此，即使在這半年內重提修法回到家戶總所得，仍是可行的。
他說，目前列入補充保險費費基的6類所得，已占95%家戶總所得，然而這6項的設計將某些所得排除、某些職業別排除，只是自亂陣腳而已，不僅增加不公平，也增加徵收難度。
民間監督健保聯盟召集人孫友聯認為，衛生署對於補充保險費每年至少要收到新台幣208億元屬過度樂觀，坊間也有公司開班授課如何避開課取補充保險費；新制（二代）健保讓同所得，因不同的保費制未來在上路後仍會引起許多糾紛。