台灣證券交易所主管表示，若就擴大稅基的角度來看，復徵證所稅後，由於投資人有賺有賠，能實際課得的稅金有限，且若採1988年併入個人綜合所得稅的方式，投資人投資出現損失，可分3年扣抵所得稅，加上目前千分之3的證券交易稅勢必配套下調，稅基並不一定會有明顯擴大。
此外，證交所主管認為，為了規避證所稅，市場恐會出現人頭戶浮濫的現象，且多數人頭戶可能是年長者、遊民等沒有工作者，稅捐機構要徵稅有其困難度。
券商也認為，課徵證所稅對於今年才初見生機的台股，絕對不是好事，目前證交稅已含有資本利得的性質，且稽徵容易，稽徵成本最低，且證交稅行之多年，市場都已習慣，在證券投資已成為「全民運動」下，政府若要復徵證所稅，並不適當，一定會衝擊股市。
券商指出，即使要對特定所得界定，課徵法人較具可行性，但對市場卻會產生嚴重影響，目前法人在市場比重相對一般投資人不高，但動向對市場有很大影響性，一旦法人因證所稅而縮手，影響的是廣大散戶投資人。
永豐金投顧指出，目前除了台灣與中國大陸無課徵證所稅外，亞洲國家包括新加坡、香港除以印花稅取代證交稅外，僅針對以經營投資事業為專業的投資人課徵證所稅，韓國則針對大股東且1年交易金額達30億韓元者課徵證所稅，日本與美國則有課徵證所稅。
永豐金投顧認為，若要課徵證所稅，方式以偏向新加坡、香港或韓國方式可能性較大，且目前的交易稅率勢必配套調降，避免造成台股交易成本偏高，出現外資資金排擠效應，進而影響對台股的評價。