嚴格說來，實施十二年國民教育與明星學校的存廢並沒有必然的關係。義務教育只要求國家提供足額的學校就學名額、並且不收取學費，即可。至於某個學校願意招收怎樣的學生，大可以放手讓該校自行決定，只要招足政府規定的學生名額。同樣，某個學生願意進入那所學校，可以讓該學生自行決定，政府只要保證每位學生都有學校可念（例如，在學生戶籍所在地的學校一定得接受該學生入學）。少數優良學校（即所謂明星學校）可以接受比較多非戶籍所在地學生入學。這樣的制度完全可以與十二年國教並存；最大的代價只是一些學校因招不足學生而教育經費略有浪費。
然而，明星學校存廢問題會在推行十二年國教過程冒出來，是因為推行十二年國教具有一個潛在目的：追求教育資源的公平，並且因而消弭由於考試競爭而扭曲了的教育宗旨。這種藉擴大就學名額來克服惡性競爭以及考試壓力的構想，一直是台灣教育改革者善良的願望。然而，我們認為，這個善良願望只是一個迷思。因為，這個潛在的目的是不可能藉由入學方式的改革而達成。明星學校的存在，是社會整體體制所塑造。當社會存在各種惡性競爭，當大學不斷以「追求卓越」作為辦學的目標，而祈求中、小學生不必進入卓越學校，不必重視考試與競爭，那是緣木求魚。
我們並非反對減少惡性競爭，也不是忽視考試壓力對教育的摧殘。但是，我們認為這不是教育事業單獨可以改變的，而是整個社會制度的問題。在社會充滿了激烈競爭的氛圍，要求學生不必追求卓越，這樣的教改目標注定要失敗。早期李遠哲領導的教改計劃也曾經以為“廣設高中大學”以及取消聯考，就可以達到學生快樂學習的目標。結果如何，人人皆知。
因此，教育部意圖把高中社區化，藉此逐漸消除明星高中的作用，這是不可能達成的目標。非特如此，如果公立明星高中平庸化，按資本主義市場邏輯，必然出現優良的私立學校——但是，學費高昂。其結果將是教育機會更加不公平。有錢人的子弟可以上明星學校（私立的），社會貧富兩極化將再生產下去。