馬總統下午由教育部長蔣偉寧、國史館長呂芳上等人陪同，到位於南投市中興新村的台灣文獻館視察。
總統首先進入史蹟大樓參觀台灣原住民展示室、日治時期台灣總督府檔案及珍貴文物，包括霧社事件、余清芳、羅福星等抗日史料，以及廖添丁拒捕搜查始末。馬總統相當感興趣，不時彎腰仔細查看。
馬總統表示，台灣參加三二九（黃花崗）之役共有2個人，羅福星就是其中之一，今年3月3日是羅福星殉國紀念日，他就特別到苗栗紀念館參加紀念儀式。
在聽取台灣文獻館長張鴻銘的業務簡報後，馬總統特別談到釣魚台的相關史料，他除了對釣魚台歷史文獻如數家珍，也希望文獻館對於日治時期台灣總督府檔案及其他文獻是否有釣魚台的相關記載，能進一步蒐集瞭解。
馬總統表示，釣魚台在1895年4月17日馬關條約簽署後隨台灣被日本兼併，但據他了解，當年1月14日，日本內閣就已決定兼併釣魚台，只是沒有發布消息，「很不尋常」。
馬總統說，「在我們來看，釣魚台既是跟著台灣一起過去的，就要跟著台灣一起回來」，這是政府對釣魚台事件的法理與歷史基礎。
馬總統也表示，台灣歷史在小時候接觸得很少，應該讓更多人知道，如果有新的發現更應納入教科書，成為大家歷史知識的一部分。總統還特別舉蔣渭水揭發霧社事件日本人使用毒氣的歷史，希望能以故事呈現給下一代知道。
馬總統強調，對於歷史應該就事論事、實話實說，讓民眾瞭解過去、珍惜過去，「也更有信心邁向我們的未來」。
台灣文獻館是於民國91年1月由原來的台灣省文獻委員會改隸國史館，成為總統府唯一的三級機關，負責台灣文獻史料的採集、整理、典藏、文獻書刊的出版及史志的纂修等工作。