大陸國務院台灣事務辦公室主任王毅今天表示，平潭綜合實驗區是經濟項目，不是政治項目，不是兩岸公權力的合作項目，也不是「一國兩制」的項目，「我們從來沒有這樣的想法」。
對於國台辦的說法，經濟部高層不願表示意見，僅強調，只要是經濟部核准赴大陸投資項目，經濟部以往不太會過問其目的。
但高層也說，現在連重慶、新疆都有台商前往投資，但平潭綜合實驗區當地氣候並不好，還有交通不便與腹地不大等缺點；若是地理位置重要，廠商早就會選擇就近投資，因此他認為，廠商進行投資時自會有其考量。
不過，由於近來外界頻頻關注平潭綜合實驗區，經濟部說，會持續關切這個開發區的後續發展。