文建會主委龍應台上任後，第一個面臨的重大挑戰就是文建會將於520正式升格為文化部，屆時包括新聞局、教育部等相關業務將納入文化部，組織再造工程相當複雜繁瑣。
升格為文化部後，預算將擴增至新台幣168億元。龍應台坦承，包括文化界爭論不休的資源分配問題，以及該如何編列預算反應施政重點，都讓她大傷腦筋。她說：『(原音)譬如說像視覺藝術圈有很多的抱怨，說資源都到表演藝術去了，我們視覺藝術都沒有！但是你也不能只是跟著藝文界的聲音走，為什麼呢？文學界都沒有人說話，真的要看資源比例的，台灣文學比例是最少的，所以我們現在要做的就是老老實實你把資源打開。』
龍應台表示，由於時間太過匆促，文化部成立的過程不可能很完美，一定會有很多缺失需要一步步改進，因此目前正在著手編列的文化部第一年預算，也可能因為必須遷就現有的組織業務內容，而不會有太大幅度的變動。不過，龍應台指出，外界還是可以從文化部的預算編列看出她的施政優先順序，希望把錢花在刀口上。