對於海軍需求的八艘潛艦是要外購還是國造，馬政府上台後至今仍無明確方向。高華柱在答覆民進黨立委陳其邁質詢時說，軍方目前還是以向美國爭取採購潛艦為主，國造則要審慎評估，其他國家售台潛艦的許可獲得則相當困難。
國民黨立委林郁方說，台船宣稱有能力自製潛艦是「盲勇總比膽小好」。不過國防部長高華柱在立院答詢時則不諱言，台船會不會信心過度？軍方也怕是「糊塗膽大」。
海軍參謀長黃曙光中將更明白表示，台船的潛艦國造計畫報告不夠成熟，尤其是潛艦「紅區裝備」；像是戰鬥系統、聲納和魚雷等如何製造，台船都沒能力可以做到。海軍評估，台船自製潛艦的能量還是不夠成熟，目前海軍仍是希望對美軍購。
高華柱也說，潛艦除了載台還有武器裝備的獲得，國內這方面的自製能力是否真的成熟，都是國防部評估重點。
此外，高華柱在答覆立委質詢時也指出，如果台海爆發衝突，最可能支援台灣的還是美國，另外國軍在釣魚台和南沙太平島的主權維護上，也都擬定有作戰計畫。
此外，對於是否即將入主國安會，國防部長高華柱昨天答覆多名立委關切時，先說全是外界猜測，後又表示這事就像買彩券，「會中獎就會中」。他還引述前行政院長蘇貞昌的話說，「人生的劇本早就寫好，但不能偷看」，要立委在五二○後「拭目以待」。