台灣生態工法發展基金會董事長賀陳旦指出，此案在去年1月29日動工，動工5個月後第1次監督小組會議才在6月24日召開，並不合理。今年1月17日召開第3次環保監督小組會議，開會頻率低使監督功效不彰，且監督小組委員無任何制衡實權，多只能接受訊息提供建議，但多次委員的建議又未受重視，恐怕監督委員已失去監督效能，淪為背書。
交通部公路總局蘇花公路改善工程處長邵厚潔對此回應，資訊已非常公開，相關資訊都有公布在網路上，可能各界見解不同，對環保監督小組功能有不同想法。
台9線蘇花公路山區改善計畫環評在民國99年11月「有條件通過」，為因應生態環境影響劇烈，環評審查結論明訂交通部公路總局須召集成立「環境保護監督小組」，進行蘇花公路山區改善計畫沿線環保與工程中環境影響監督。
地球公民基金會研究員曾雨涵表示，交通部公路總局依環評結論設置的「環保監督小組」共17名委員，民間代表僅2名，其他多是公部門，遠低於其他機關同類型監督小組的席次比例。
千里步道籌畫中心執行長周聖心認為，許多開發單位在環評「有條件通過」後，常有「頭過身就過」的心態，蘇花公路山區路段改善計畫的環保監督小組的功能遭弱化，難以落實環保監督功能，更與當初環評結論要求設立環保監督小組的立意違背。