國防部國會聯絡處傳出有人涉及盜領加班費等問題，全處人員都遭到軍檢約談釐清案情，也讓這個曾出過二位上將的幕僚單位受到矚目。
過去在立院、監院及國民大會均視為國會的時期，軍方為加強與三個國會的聯繫，成立任務編組的國會聯絡室，並由部長辦公室主任兼主任，但軍方早期的作風保守，做法守舊，屢遭到三個國會的批評。
軍方國會聯絡工作出現質變，是在李天羽擔任空軍總部國會聯絡室少將主任時期，李天羽把這個原本的冷單位，賦予創新的思維，並且把國會聯繫工作當成作戰，強化內部編組，不僅成功的活化國會聯絡工作，也讓李天羽直升國防部國會聯絡室主任，並且升中將，李天羽日後更因此結識朝野立委，成為日後晉任一級上將參謀總長、國防部長要職的原因之一。
國會聯絡室因應軍方組織法制化的需要，正式納入國防部長辦公室所轄屬的幕僚單位，改為國會聯絡處，處長改為少將編階，由於需要日夜與朝野立委相處，得隨時向國防部長報告立院動態，長期以來被視為國防部長的心腹及親信。
前總統陳水扁在二千年上任時，軍方推薦由時任國會聯絡處長的余連發少將，擔任扁的首任總統侍衛長，獲得扁的首肯，余連發也因此扶搖直上，從中將侍衛長做到憲兵司令、軍情局長，最後升任後備司令，官拜陸軍上將。