世耕參議員在質詢時指出，台灣是全世界最早對日本伸出援手、賑災捐款最多的國家，台灣官方、民間加起來的捐款高達二百億日圓，然而台灣駐日副代表羅坤燦出席追悼儀式，卻被安排在二樓與日本企業、團體同席，也沒受邀上台獻花，日本政府的作法未免太失禮了。
內閣官房長官藤村修表示，座位是由事務人員安排的，日本政府的立場是根據一九七二年的《中日聯合聲明》，與台灣之間維持非政府間的事務關係。一些國家的大使被指名獻花，然而台灣「駐日經濟文化代表處」的定位是經濟文化機關。
世耕強調，他也了解日本在外交上有許多難處，但此時應跨越外交難處，好好回應台灣的深摯友情才對，他身為一個日本人，覺得政府的作法讓他感到很抱歉，他認為野田應該代表國家向台灣道歉。
野田答詢時表示，台灣在三一一大震災中給予日本溫暖的援助，如果日本有傷害到台灣的心意，他真的覺得非常抱歉，對於沒有處理周到，他將深切反省。
日本外務省十二日晚在東京飯倉公館舉行儀式，追悼東日本大地震遇難者，並向給予援助的世界各國表達謝意。儀式由外相玄葉光一郎主持，約一百四十個國家的外交官員受邀，台灣方面由羅坤燦副代表出席。
另一方面，日本交流協會十二日也在台舉行追悼及復興感恩酒會。為表達台灣全力支持日本重建的心意，應邀出席的馬英九總統在晚會上宣布，即日起除日本福島第一核電廠半徑卅公里內區域及「計畫避難區域」外，福島縣其他地區的紅色旅遊警示全部解除。
酒會由日本駐台代表今井正親自主持，他代表日本政府感謝台灣各界在震災中鼎力相助。除馬英九，副總統當選人吳敦義、外交部長楊進添、亞東關係協會會長廖了以、新任駐日代表沈斯淳外，我政府、國會代表均應邀出席。