會議紀錄 都是事後追溯
九日公布的文件是含括去年九月至十二月間，日本內閣全體閣員針對三一一災難召開的「原子力災害對策本部」會議內容，這些內容都沒有做成詳盡紀錄，而是事後追溯重現而成。
從文件顯示，日本高層對危機的處理缺乏透明度，同時消息混亂、資訊不足、反應慢半拍，以及政府、災區與電廠三方溝通不良，甚至有閣員反映，當核電廠狀況惡化之際，感覺群龍無首。
根據其中一份的會議摘要顯示，在福島核一廠冷卻系統失靈約四小時後，一名官員在三月十一日晚間七點政府召開的首次該項會議中提到︰「如果反應爐爐心溫度持續升高八小時，將可能發生熔毀。」會議主席是當時日本首相菅直人。
爐心熔毀 當局淡化處理
顯然日本當局決定淡化處理爐心熔毀的嚴重性；日本原子力安全保安院一名發言人在翌日的記者會上，不經意說出爐心可能熔毀後，立即遭到撤換。經營電廠的東京電力公司與政府一直到五月中旬才承認反應爐爐心部分熔毀。
當時代表政府出面說明災情處理的內閣官房長官枝野幸男則一再對爐心熔毀的看法加以駁斥，並要求其他閣員謹慎發言。他現已轉任經濟產業大臣。
此外，在三月十二日的另一份文件，當時的國家戰略大臣玄葉光一郎提出質疑︰「反應爐爐心有可能熔毀，因此疏散區設定在十公里妥當嗎？不需再重加考慮嗎？」當天中午，日本當局將疏散範圍擴大至電廠半徑二十公里，菅直人說，二十公里疏散區足夠了。
專家報告 擬撤東京群眾
菅直人一直到三月十六日才警告他的內閣，福島危機可能比一九八六年的車諾比事件還嚴重。近十天後，日本原子力委員會報告指出，災難的規模恐需疏散大東京區三千萬群眾，為避免引發驚慌，日本政府隱匿這份報告。
政府部門間的協調失當也增加輿論對當局處理核災方式的嚴厲批判，同時更深化民眾對政治人物與官僚系統的不信任。當時的內務大臣片山善博在三月十五日的會議上直言︰「誰是任務行動真正的領導人？我接到許多前後不一致的要求，似乎沒有人在負責。」
指令不明 造成福島危機
國際原子能總署署長天野之彌九日在維也納表示，造成福島危機的並不僅是天災；救災指令的不明確、反應計畫的整合不足、主管監督的不充分以及應變訓練不足等都是原因，他說︰「類似這樣的錯失並非日本獨有，人類總是在錯誤中學得教訓。」