行政院昨晚宣布美牛議題的政策方向，將秉持安全容許、牛豬分離、強制標示、排除內臟等原則，對飼料添加萊克多巴胺（Ractopamine）的牛肉「有條件解禁」，行政院將配合立法院修法，強化溝通。
林祖嘉認為政府對美牛議題朝「有條件解禁」，是利益大風險小。
他分析指出，消費任何商品都會有風險，政府要做的就是要設法把利益極大化、風險極小化。林祖嘉認為，「美國對我們實在太重要了」，包括台美貿易暨投資架構協定（TIFA）、跨太平洋夥伴協議（TPP）、美簽、軍售等，都是非常重要的利益。
林祖嘉說，美國對台灣的利益非常重要，如果受美牛爭議影響，台灣在未來談判後續合作問題，恐怕要付出更高代價，因此有限度解禁，從國家整體利益而言，應是較折衷的做法。他也特別提醒，政府一旦宣示有條件解禁的政策方向後，也應相對要求美國加速復談TIFA進程、及美簽、軍購等議題速度。
不過，林祖嘉也不諱言必須討論美牛風險究竟有多大？他說，對於正反意見，應尊重專業尋求正確解答。但畢竟瘦肉精與狂牛症是完全不一樣的議題，因此政府必須在政治、經濟利益上考量，「讓報酬極大化，風險極小化」。
在國家政策研究基金會擔任科技經濟組召集人的林祖嘉表示，政府對含萊克多巴胺的美牛，做出「安全容許、牛豬分離、強制標示、排除內臟」有條件解禁的政策宣示，未來進口美牛就應像香菸一樣清楚標示；此外，也許可以考慮限制銷售通路等安全管制措施。政府應做好配套，讓消費者安心。