馬英九昨天上午邀集相關部會召開國安層級的「政策議題討論簡報會議」，原訂議程為討論美牛解決方案，然而Ｈ５Ｎ２疫情擴大，更涉及政府隱匿疫情爭議，會議開始便先由農委會主委陳保基報告Ｈ５Ｎ２高病原性禽流感，衛生署長邱文達補充說明後，與會官員進行討論。
總統府發言人范姜泰基會後轉述指出，馬英九總統高度關切疫情發展，當場要求農委會必須針對延遲疫情通報向國人道歉，並懲處相關人員，同時積極強化後續防疫工作，並要求農委會積極強化防疫工作，妥善進行善後工作。
媒體問及防檢局長許天來請辭獲准，是否符合馬英九要求懲處官員層級？范姜泰基沒有正面答覆，他僅表示，許天來請辭當時，總統正在主持「政策議題討論簡報會議」。
農委會昨天也舉行臨時記者會，由副主委王政騰主持。面對外界排山倒海質疑農委會隱匿疫情，他強調，農委會已將全案移送監察院調查，以釐清各界疑慮。媒體追問拍攝紀錄片《不能戳的祕密》的李惠仁向台北地檢署控告防檢局竄改病毒檢測報告、隱匿疫情，王政騰只表示，全案已進入司法程序，農委會已提出證據給檢察官。
王政騰強調，所謂Ｈ５Ｎ２高病原性禽流感病毒，是指對家禽具有高傳染率和高致死率，目前全世界各種文獻及案例報告都顯示，Ｈ５Ｎ２跟人類健康沒有關係，社會大眾勿須過度恐慌。
他表示，許天來非常盡忠職守、努力從公，是個非常有專業、認真的首長，也是有擔當的人，幾天前就向主委陳保基請退，顯示他是個非常坦蕩的人。
許天來則表示，禽流感引起社會不安，總該要有人負責。問他是否有被「棄車保帥」的委屈時，他直說「沒有」；「跟其他工作比較，這個位置（防檢局長）沒有特別辛苦，但真的不好幹，我都六十多歲、頭髮都白了，應該退休了。」
外界指控他隱匿疫情，許天來說，禽流感疫情各界有不同意見是一回事，但公務人員一切行事應符合法律規定；這次檢測出Ｈ５Ｎ２病毒，判讀確有困難，尤其是確認為高病原禽流感後，感染禽場必須全場撲殺，涉及民眾財產權益，政府任何措施一定要有充分科學證據。