沈斯淳昨天也強調，台日雙邊溝通管道早已制度化，日方有什麼意見，國內相關部會都能掌握訊息。有關外界近期對他個人的評價及觀察，沈斯淳一概表示尊重，就連「龜毛」二字也一笑置之，不多做反駁。但沈斯淳強調，每個人有各自的條件，只希望自己能利用現有條件，把分內工作做得更好。
沈斯淳確定駐日，缺乏涉日背景引起外界質疑。高層表示，近兩年來台日雙方簽訂開放天空、投資協議之後，台日關係是四十年來最好的時期，雙邊關係也日趨制度化。高層認為，這與過去需要由總統親信才能突破政治限制，達到特定外交目標的時空環境，已有所不同。
高層表示，未來台日關係最重要的關鍵因素，還是馬英九個人；因為所有外交政策依然由總統所主導，駐日代表必須能夠精確執行總統的政策指示方向。
高層同時指出，沈斯淳係外交部建議人選，他在常次任內負責督導亞太及日本業務，不僅常陪外賓晉見總統，也經常參與內部相關會議，無論是他本人對相關業務，以及日方對他，都有一定的熟悉，接掌台日關係足可勝任；同時，馬英九指派前國民黨祕書長廖了以出任亞東關係協會會長，負責台日關係的第二軌交流，相信應可與沈斯淳密切合作。
現任駐日代表馮寄台請辭獲准，府方人士表示，馮寄台在選前就表達選後將辭職的態度，馬英九多次慰留，但馮堅持母親已高齡九十，希望能返台照顧母親。府方人士透露，馬英九想到自己的母親也已九十歲，但還能經常回家善盡孝道，所以非常能夠體會馮寄台的心情，最後才勉予同意。