審計部今天指出，行政院在民國90年核定連江縣政府辦理「馬祖福澳港區擴建計畫」，工程經費22億元，計畫預計執行期程為90年6月至94年6月；但是從90年6月執行至今，已超過10年仍未完成，較預計完成期限延宕6年多，執行進度嚴重落後。 審計部稽查發現，這項計畫有多項重大違失，包括，沒有切實評估福澳港區運量需求，妥適擬具建設計畫，導致後來必須重新檢討運量需求而縮減興建規模，拆除部分碼頭已打設完成的鋼管樁，損失公帑2億1255萬餘元。 審計部指出，連江縣政府專業能力不足，無力督導廠商覈實履約，衍生防波堤塊石嚴重低估、碼頭位移等問題，這部分就花費1億5959萬餘元進行改善，且善後處理費時5年，行政效率不彰。