前最高法院院長楊仁壽今天表示，最高法院應堅持保密分案；但司法院認為保密分案不等於審判獨立，「法官籲請改革最高法院行動聯盟」則表示，保密分案應立刻就改。
最高法院於民國39年政府播遷來台後即建立保密分案制度。保密分案的設計採二階段分案，前階段分案股行政人員知道「編號案」及案件內容，無法得知案件分配情形；後階段分案法官能由「保密案號」，查照輪次表後，得知承辦法官，卻無法得知案件內容。
二階段的分案制度，如同兩支互有缺口的鑰匙，互相分工、箝制，兩支鑰匙必須合體，才能得知完整分案情形。因此，除了承辦法官外，其他人員均不知道每個案件由誰承辦。
1名曾在最高法院擔任法官的法界人士指出，上訴至三審的案件送到最高法院後，審查庭認為符合上訴程序的案件，由保密分案程序辦理分案；但若案件涉及死刑、無期徒刑、當事人在監、在押、案件久懸等狀況，則直接逕行分案。
法界人士表示，分案法官會把案子編號，經由電腦程式平均分案給最高法院法官，案件分好後，分案法官會把案件相關卷宗放進袋子裡，並掛上承辦法官名字，由工友將案件送至各法官手上。
由於看不出袋中裝的是哪個案件，所以沒有人知道哪名法官承辦哪個案件，直到進行評議當天，該庭的評議成員才會知道所承辦的案件。
一名贊同保密分案的高院法官指出，若是案件審理前即可得知受命法官，會增加關說的可能及法官人身安全的顧慮。如不採保密分案，則可能有記者堵人跟蹤、當事人在法院外抗議等干擾法官的舉動。
不過這名法官指出，目前最高法院裁判書合議庭的法官名字是依年資排序，他贊成判決後，可像高院裁判書一樣，將受命法官名字寫在裁判書的最後，以示為所做的判決負責。