國際間盛傳中國大陸與韓國自由貿易協定（FTA）談判即將在3月展開，卓士昭強調，以台灣與韓國產品競爭性強，有高達7成比重產品重疊情況來看，若中韓FTA進展順利，韓國產品在大陸得到比台灣更好的待遇，的確會造成台灣產品進入大陸市場的障礙。
不過卓士昭也強調，對中韓自由貿易協定談判，台灣方面高度關注，也會列入台灣目前與大陸已經展開兩岸經濟合作架構協議（ECFA）後續談判的「重要考量」。卓士昭強調，以台灣的角度，至少台灣與韓國的立足點要平等。
此外，卓士昭也表示，以目前國貿局獲得資訊顯示，中韓要正式坐上談判桌，必須先解決農產品問題，外界傳出中韓FTA可望在3月展開談判，國貿局評估「不會太快」。
國貿局官員對中央社記者表示，韓國與台灣一樣，農產品市場開放具有高度敏感性，而大陸部分農產品具有相當好的競爭力，對韓國而言會有相當大的市場開放壓力，雙方要在短時間內解決農產品談判原則，官員認為恐怕不太容易。
中韓FTA有農產品問題，中央社記者詢問，兩岸ECFA是否確定已經排除洽談農產品？卓士昭則不願意正面回應，他說，「下次見面（指兩岸談判團隊）才會確定」，現在他不方便把底線說太清楚。
不過當中央社記者表示，大陸官方已多次表明台灣可以開放沒有生產的農產品登台，卓士昭僅說，「他們講了很多次」，不願意再進一步說明，對馬總統不開放大陸農產品進口的立場，他則說，「目前沒有改變」。