新內閣上路後，各部會隨即展開政務副首長遴選，財政部政務次長已內定由世新大學管理學院院長徐仁輝出任；徐仁輝也是周錫瑋擔任台北縣長期間，負責接掌財政局長，這次出任財政部政次人事布局頗受矚目。
此外，新聞局長楊永明日前公開提到「對總統大選各方面有協助的，將在政務副首長納入安排考量」；包括立委張顯耀、黃義交、鄭麗文等人都被高層納入口袋名單，可望延攬進入政務或國安體系服務，目前仍在徵詢階段。
決策高層透露，這些優秀卸任立委可以延攬進入行政體系服務，也可能留任選區繼續耕耘服務，徐圖下一次選戰東山再起，近期將會密集約談並徵詢個人意願。
另外，在國安外交系統人事調整部分，已知國民黨秘書長廖了以卸任後，確定將接任亞東關係協會會長，原任會長彭榮次即將卸任；彭榮次以往具有前總統李登輝色彩，不過，黨政人士解釋，此次人事調整純屬任期考量，沒有其他因素。
據透露，駐新加坡代表史亞平確定納入這波人事調整，近期即將奉派回國，接替人選以經貿背景為主，以延續台星經濟協議後續談判；對於傳出史亞平「踩紅線」說法，國安系統傳出史亞平與星國政府互動「衝太快，讓對方高層不悅」，但府院相關人士低調不願多談。
國安系統也傳出駐日代表馮寄台可能繼任外交部長，國安會秘書長胡為真將外放擔任駐美代表，但仍待高層最後考量，此一人事布局尚未獲得證實。