縣府表示，動物疫病災害防救應變小組由縣府環保局、衛生局、消防局等11個單位組成，3天內完成全縣偶蹄類動物畜牧場的訪視工作，如發現有異狀的動物，立即撲殺與環帶防疫措施。如未再發現病例，顯示疫病應只侷限在原發生場的小區域內，後續由縣動植物防疫檢疫所持續進行全縣口蹄疫疫苗補強注射及採血檢驗工作。
縣府環保局支援消毒工作，必要時由縣府民政局協請軍方支援。各單位應預先準備分工的人力、資材，隨時準備投入防疫救災。撲滅疫情費用除中央機關依動物傳染病防治條例補助外，縣府則動支第二預備金因應。應變小組定期召開會議，下次會議訂在6日，如疫情緊急，則隨時召開。
擔心民眾不了解口蹄疫病毒，產生恐慌心理，造成生活的不便利，縣府今天再次強調，口蹄疫病毒非屬人畜共通傳染病，不會影響人體健康，且加熱熟食後，病毒就會被殺死。
縣府表示，上市豬隻都由合格獸醫師檢查合格後才可屠宰，且這次發生場周邊3公里的高風險區域內養豬場，都已依規定移動管制15天，短期內不會送到肉品市場，待疫情完全控制後才可解禁。
2場受感染豬場的全數豬隻2日晚上撲殺焚化，周圍3公里畜牧場徹底消毒，並實施移動管制及口蹄疫疫苗補強注射等環帶防疫措施。縣府防疫所2日到今天，連續3天完成高風險3公里的環狀區域內21場養豬場及166場養牛場疫情調查，牛豬都沒有異常，初步研判疫情已獲控制。
縣府防疫所人員今天持續處理感染豬場環境，確保病毒被消弭。