去年1月14日行政院衛生署鄭重召開記者會，宣布台灣自民國96年開放美國牛肉進口以來，首次驗出瘦肉精成分「萊克多巴胺」。一年多來，美國和加拿大進口牛肉、豬肉因瘦肉精殘留，遭到擋關退運，尤其今年春節前更多達數百噸。
瘦肉精問題早就存在，問題在於要不要檢驗，衛生署食品藥物管理局食品組長蔡淑貞指出，瘦肉精原本不驗，直到民國99年底，衛生署列為肉品常規檢驗項目，進口和國產品肉品一視同仁，國產肉品和進口美牛，都有檢出瘦肉精的案例。
美國牛肉原本是台灣進口牛肉的主要來源國，民國92年12月24日美國出現第一件狂牛症，行政院農業委員會將美國劃入狂牛症疫區，美牛禁止輸入台灣，直到95年1月25日，衛生署才同意開放30月齡以下去骨美牛進口。
對美方而言，美牛貿易還有個障礙，就是農委會95年10月11日公告瘦肉精為「動物用禁藥」，禁止製造、輸入、販賣及供產食性動物使用。雖然美國、加拿大26個國家地區允許使用瘦肉精成分「萊克多巴胺」，農委會卻從未核發此藥的許可證。
衛生署雖然在民國96年8月10日召開「肉品中瘦肉精殘留管理研商會議」，14日預告瘦肉精檢出標準，輿論嘩然，豬農一週內赴農委會陳情，向衛生署潑灑豬糞抗議，衛生署和農委會事後承諾，瘦肉精不解禁、不修法，迄今台灣與歐盟一樣，未核准使用瘦肉精。
全案演變至今，國內和進口的肉品都要把關瘦肉精，不僅每月都成千上萬公斤進口美牛因檢出「萊克多巴胺」，遭到退運；國內禽畜養殖者使用瘦肉精成分「沙丁胺醇」、「克崙特羅」，由檢方介入調查。
台灣大學專業獸醫學院名譽教授賴秀穗指出，合法使用萊克多巴胺，可減少飼料用量、增加精肉、降低排洩物，部分本土禽畜農戶出於成本考量，私下使用其他更毒的瘦肉精成分，農委會近年抽檢本地屠宰豬含瘦肉精的案件中，有0.81%到1.71%的肉品檢出瘦肉精的殘留。
台美雙方在99年10月22日簽署美牛輸台議定書，衛生署隨後在11月2日公告「修正美國牛肉及其產品之進口規定」，進口美牛品項增列帶骨牛肉，此議定書條文明定雙方可在簽署後半年再行協商，為重起美牛貿易談判，解決瘦肉精爭議，預埋伏筆。
衛生署食品藥物管理局長康照洲坦承，「瘦肉精解禁的問題，一直在談」，但正如同內定農委會主委陳保基所言，「美牛議題不是單純的農業和食品的技術問題」，在美方壓力、消費者安全、保障本土農民權益的多方考量下，美牛問題是新內閣需要跨部會處理的燙手山芋。1010201