吳清基直到前天中午前都未被告知要異動，他也認為自己不致於現在被換，當時還交代技職司規畫到南部具有特色的技職校院參訪事宜。沒想到，計畫趕不上變化，最後他還是要離開教育部長職務，甚至連傳聞的政務委員都沒有，相當不堪。
吳清基去職確定後，不少電子媒體還報導他將接任政務委員。昨天的新閣記者會中，吳清基並未在政委名單之列，只當了「一天政委」。
兩年前，他拒絕接受徵召代表國民黨參選大台南市長，這次下台似乎是必然，但被高層這樣對待，難免讓他傷心。
行政院長吳敦義昨天主持臨時行政院會並率內閣總辭，他鐵青著臉參加，隨後內閣合影畢業照。拍照結束後，行政院長吳敦義找吳清基談話安撫。之後，吳清基快閃跑讓媒體追，對媒體詢問只低調說「謝謝」。但吳清基稍後跟友人吃飯時，仍抱怨未被尊重，心情低落。
吳清基昨天下午開始打包，接任他職務的中央大學校長蔣偉寧原本要去拜訪，他沒有接受，改到今天上午兩人見面。吳清基昨天整天心情鬱悶，不願跟媒體有互動。
吳清基下台有很多原因，但據了解，二○一○年五都首長選舉，國民黨苦苦找不到戰將參選大台南市長，打算徵召台南人吳清基披戰袍，但他拒絕了，讓國民黨高層相當不悅。這次內閣改組，其他要卸任官員都提前好幾天就被告知，吳清基卻在前一天才知道要被撤換。
對於吳清基去職，黨政人士表示，包括馬英九、陳冲都已致電他解釋說明，未來仍會有職務安排。