國防、外交及兩岸部會首長在這波內閣改組中全部留任，不過仍可能在520總統就職時有所異動。外傳國防部長高華柱屆時可望轉進國安會秘書長，甚至已獲高層徵詢。對於這項傳聞，高華柱1日予以否認，強調「絕無此事」。高華柱說：『(原音) 絕無此事實，這都是一般媒體的猜測！』
高華柱指出，不論內閣改組前或改組後，國軍都會按既定的年度計畫與政策操課。對於軍方人事調動傳聞，他指出，軍方人事一切按照制度，到目前為止沒有任何人事異動徵兆。高華柱：『(原音)我們整個內閣已經確定，我個人奉命繼續在國防部服務，希望大家繼續給我指導。到目前為止，還沒任何有人事異動的徵兆。』
高華柱強調，政務官隨時都要做好自身的本份工作，「當一天和尚、撞一天鐘」。他並引用西方基督教的名言「明天如果是世界末日，今天我也要把這棵葡萄種籽種在土中」，強調這是政務官重要的責任與心態，只要在崗位上，就要盡全力把工作做好。