◎實現環境正義 阿塱壹應成國家自然公園
保留台灣最後1%的原始海岸森林─阿塱壹古道，一直是環團一致的意見。選前數十個環保團體也上凱道展現難得的團結氣氛，要求政府停建台26線，並獲得國、民、親三黨民意代表的支持。屏東縣政府也趕在暫定自然保留區時效屆滿之前，在1月18日召開審查會議，通過將阿塱壹古道列為正式自然保留區，消息傳來，全台環保團體同感振奮、欣慰。
不過，長期致力保留阿塱壹古道的屏東環保聯盟執行秘書劉哲瑋說，目前的保留區仍然停在縣府層級，未來仍有變數，如果馬總統真的有心要實現環境正義，應該讓阿塱壹古道成為第二個國家自然公園。他說：『(原音)如果說未來的縣長是開發派的，那可能就沒辦法保留，其實以縣級的審查來講，大概是縣長的意志，你要做什麼大概都可以決定一切。所以我們覺得說縣級的保留區其實還不是一個最好的保護傘，如果說馬政府願意的話，柴山是台灣第一個國家自然公園，繼柴山之後，是不是阿塱壹可以變成第二個國家自然公園。』
◎停止「山海BOT」 留下美麗東海岸
台灣的東海岸是目前環保團體與政府角力的另一個重要戰場，地球公民基金會花東辦公室主任蔡中岳指出，東海岸是國內僅存尚保有自然景色的海岸，但從花蓮到台東短短的數十公里海岸，目前已有十餘個開發案正進行開發、或試圖從環評中過關，取得開發許可，尤其是東發條例通過後，杉原、都蘭灣一帶的開發案，更可能使環境遭到無可復原的浩劫。
蔡中岳也指出，目前政府已經開放陸資來台進行觀光遊憩設施的投資，環保團體擔憂，台灣東部的自然資源，將在BOT開發案下支離破碎。蔡中岳說：『(原音)我們非常擔心，因為要蓋觀光一定要找漂亮的地方，台灣東部這麼豐沛的自然資源，有可能就會有更多的人想要覬覦這塊土地，尤其在馬總統對於中國大陸的政策一直是比較開放的狀態下，會不會鼓勵、甚至協助這些陸資來東岸進行觀光的建設、開發，是我們最擔心的部份。』
◎國光石化 死灰復燃？
2011年環境事件中，最令環保團體津津樂道的，就是馬總統在國光石化開發案爭議中表示「不支持國光石化設在彰化」，讓彰化縣大城鄉與芳苑鄉的濁水溪北岸河口濕地留下生機。
不過，環保團體也指出，馬總統只是不支持國光石化設在彰化，但是仍然支持石化業的發展，他們擔憂選後國光石化可能會死灰復燃，繼續在其他地點設廠，同樣造成生態浩劫。彰化環盟總幹事施月英說：『(原音)我們知道國民黨是說他覺得石化業是要擴張，他們只是不同意他在彰化設廠，這對我們一般民眾的感受是非常強烈的，就是國光石化怎麼會還想要在台灣設廠？民眾的反對這麼強烈，為什麼政府還要一直滿足這些石化業？我覺得馬總統應該要避免這個事情。』
此外，施月英也指出，台塑一再以六輕四期擴建名義，試圖擴廠，也都可能破壞環境，因此希望馬總統當選後能宣示對這些開發案的立場。
馬英九總統在選前多次高喊落實「環境正義」，不過從環保團體的擔憂來看，馬英九總統的挑戰，才正要開始。